一、生物膜-膜反应器（复合MBR工艺）

在膜生物反应器系统中加入填料形成生物膜，附着和悬浮生长的微生物协作完成对污染物的降解的过程，两相之间可转化性增强了系统的调节机制，使复合系统复杂的的生态结构具备了较强的抗冲击负荷能力。

二、厌氧MBR工艺

厌氧MBR，即厌氧生物处理与膜分离相结合的工艺。各类厌氧反应器都可以与膜分离组合使用。厌氧MBR应用的废水主要是一些高浓度的有机废水。

三、投加基因工程菌MBR工艺

基因工程菌（GEM）是指运用生物工程技术把某种降解菌转入菌株，培养出具有降解功能的特种菌。

四、好氧颗粒污泥MBR工艺

在好氧颗粒污泥MBR工艺中，好氧颗粒污泥浓度可维持在14~16g/L，较高的污泥浓度和颗粒污泥内部缺氧、厌氧环境的存在，使MBR中硝化和反硝化并存。

五、强化MBR脱氮除磷工艺

几乎所有的传统脱氮除磷工艺都可以与MBR结合，MBR工艺的一些自身特点可以强化原有的生物脱氮除磷工艺，膜对生物量的完全截留可以提高硝酸菌和聚磷菌的总量，从而提高系统脱氮和除磷的能力，减少污泥膨胀导致的脱氮除磷前提下，可以减少污泥的排放，提高单位剩余污泥的含磷量。